Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cox5bP19536 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cox5bP19536 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cox5bP19536 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cox5bP19536 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cox5bP19536 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cox5bP19536 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cox5bP19536 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cox5bP19536 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cox5bP19536 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cox5bP19536 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cox5bP19536 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cox5bP19536 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cox5bP19536 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cox5bP19536 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cox5bP19536 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cox5bP19536 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cox5bP19536 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cox5bP19536 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cox5bP19536 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Cox5bP19536 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cox5bP19536 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cox5bP19536 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cox5bP19536 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cox5bP19536 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cox5bP19536 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cox5bP19536 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cox5bP19536 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cox5bP19536 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms