Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms