Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxcl9P18340 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms