Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa-rs1P17533 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa-rs1P17533 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa-rs1P17533 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa-rs1P17533 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms