Protein–RNA interactions for Protein: P16330

Cnp, 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnpP16330 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CnpP16330 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CnpP16330 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CnpP16330 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CnpP16330 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CnpP16330 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CnpP16330 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CnpP16330 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CnpP16330 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CnpP16330 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CnpP16330 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CnpP16330 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CnpP16330 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CnpP16330 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CnpP16330 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CnpP16330 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CnpP16330 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CnpP16330 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CnpP16330 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CnpP16330 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CnpP16330 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CnpP16330 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CnpP16330 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CnpP16330 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CnpP16330 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CnpP16330 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CnpP16330 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CnpP16330 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CnpP16330 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CnpP16330 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CnpP16330 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CnpP16330 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CnpP16330 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CnpP16330 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CnpP16330 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CnpP16330 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CnpP16330 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CnpP16330 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CnpP16330 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CnpP16330 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CnpP16330 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CnpP16330 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CnpP16330 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CnpP16330 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CnpP16330 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CnpP16330 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CnpP16330 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CnpP16330 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CnpP16330 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CnpP16330 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CnpP16330 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CnpP16330 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CnpP16330 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CnpP16330 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CnpP16330 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CnpP16330 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CnpP16330 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CnpP16330 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CnpP16330 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CnpP16330 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CnpP16330 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CnpP16330 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CnpP16330 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CnpP16330 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CnpP16330 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CnpP16330 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CnpP16330 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CnpP16330 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CnpP16330 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CnpP16330 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CnpP16330 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CnpP16330 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CnpP16330 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CnpP16330 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CnpP16330 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CnpP16330 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CnpP16330 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CnpP16330 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CnpP16330 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CnpP16330 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CnpP16330 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CnpP16330 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CnpP16330 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CnpP16330 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CnpP16330 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CnpP16330 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CnpP16330 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CnpP16330 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CnpP16330 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CnpP16330 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CnpP16330 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CnpP16330 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CnpP16330 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CnpP16330 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CnpP16330 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CnpP16330 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CnpP16330 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CnpP16330 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CnpP16330 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CnpP16330 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.3 ms