Protein–RNA interactions for Protein: P13412

Tnni2, Troponin I, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni2P13412 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnni2P13412 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnni2P13412 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms