Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga5P11688 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga5P11688 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga5P11688 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga5P11688 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga5P11688 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga5P11688 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga5P11688 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga5P11688 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga5P11688 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms