Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa1P11477 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa1P11477 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa1P11477 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa1P11477 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa1P11477 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa1P11477 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa1P11477 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms