Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf4P11403 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms