Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd8bP10300 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd8bP10300 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd8bP10300 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd8bP10300 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd8bP10300 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd8bP10300 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd8bP10300 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd8bP10300 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd8bP10300 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd8bP10300 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd8bP10300 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd8bP10300 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd8bP10300 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd8bP10300 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd8bP10300 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd8bP10300 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd8bP10300 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd8bP10300 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd8bP10300 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd8bP10300 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd8bP10300 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd8bP10300 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd8bP10300 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd8bP10300 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd8bP10300 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms