Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CatspereP0DP43 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms