Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnmt3cP0DOY1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnmt3cP0DOY1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dnmt3cP0DOY1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms