Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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