Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LtaP09225 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LtaP09225 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LtaP09225 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LtaP09225 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LtaP09225 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LtaP09225 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LtaP09225 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LtaP09225 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LtaP09225 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LtaP09225 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LtaP09225 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LtaP09225 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LtaP09225 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LtaP09225 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LtaP09225 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LtaP09225 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LtaP09225 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LtaP09225 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LtaP09225 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LtaP09225 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LtaP09225 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LtaP09225 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LtaP09225 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LtaP09225 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LtaP09225 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LtaP09225 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LtaP09225 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LtaP09225 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LtaP09225 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LtaP09225 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LtaP09225 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LtaP09225 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LtaP09225 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LtaP09225 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LtaP09225 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LtaP09225 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LtaP09225 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LtaP09225 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LtaP09225 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LtaP09225 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LtaP09225 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LtaP09225 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LtaP09225 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LtaP09225 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LtaP09225 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LtaP09225 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LtaP09225 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtaP09225 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtaP09225 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtaP09225 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtaP09225 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtaP09225 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtaP09225 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtaP09225 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtaP09225 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtaP09225 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtaP09225 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtaP09225 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtaP09225 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtaP09225 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtaP09225 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtaP09225 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtaP09225 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtaP09225 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtaP09225 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtaP09225 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtaP09225 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtaP09225 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtaP09225 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LtaP09225 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LtaP09225 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtaP09225 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtaP09225 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtaP09225 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtaP09225 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtaP09225 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtaP09225 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtaP09225 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtaP09225 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtaP09225 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtaP09225 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtaP09225 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtaP09225 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtaP09225 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LtaP09225 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtaP09225 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtaP09225 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtaP09225 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtaP09225 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtaP09225 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtaP09225 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtaP09225 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtaP09225 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtaP09225 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtaP09225 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtaP09225 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtaP09225 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtaP09225 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtaP09225 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms