Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Hoxb5P09079 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Hoxb5P09079 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Hoxb5P09079 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Hoxb5P09079 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Hoxb5P09079 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Hoxb5P09079 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Hoxb5P09079 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Hoxb5P09079 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Hoxb5P09079 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Hoxb5P09079 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Hoxb5P09079 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Hoxb5P09079 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Hoxb5P09079 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Hoxb5P09079 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Hoxb5P09079 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms