Protein–RNA interactions for Protein: P08775

Polr2a, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2aP08775 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2aP08775 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2aP08775 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2aP08775 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2aP08775 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2aP08775 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2aP08775 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2aP08775 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2aP08775 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2aP08775 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2aP08775 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2aP08775 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2aP08775 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2aP08775 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2aP08775 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2aP08775 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2aP08775 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2aP08775 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2aP08775 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2aP08775 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2aP08775 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Polr2aP08775 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Polr2aP08775 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Polr2aP08775 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Polr2aP08775 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Polr2aP08775 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr2aP08775 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms