Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NefmP08553 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NefmP08553 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NefmP08553 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NefmP08553 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NefmP08553 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NefmP08553 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NefmP08553 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NefmP08553 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NefmP08553 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NefmP08553 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NefmP08553 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NefmP08553 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NefmP08553 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NefmP08553 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NefmP08553 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NefmP08553 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NefmP08553 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NefmP08553 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NefmP08553 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NefmP08553 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NefmP08553 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NefmP08553 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NefmP08553 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NefmP08553 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NefmP08553 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NefmP08553 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NefmP08553 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NefmP08553 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NefmP08553 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NefmP08553 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NefmP08553 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NefmP08553 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NefmP08553 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NefmP08553 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NefmP08553 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NefmP08553 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NefmP08553 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NefmP08553 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NefmP08553 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NefmP08553 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NefmP08553 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NefmP08553 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NefmP08553 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NefmP08553 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NefmP08553 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NefmP08553 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NefmP08553 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NefmP08553 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NefmP08553 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NefmP08553 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NefmP08553 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NefmP08553 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NefmP08553 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NefmP08553 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NefmP08553 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NefmP08553 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NefmP08553 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NefmP08553 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NefmP08553 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NefmP08553 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NefmP08553 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NefmP08553 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NefmP08553 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NefmP08553 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NefmP08553 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NefmP08553 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NefmP08553 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NefmP08553 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NefmP08553 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NefmP08553 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NefmP08553 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NefmP08553 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NefmP08553 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NefmP08553 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NefmP08553 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NefmP08553 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NefmP08553 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NefmP08553 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NefmP08553 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NefmP08553 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NefmP08553 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NefmP08553 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NefmP08553 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NefmP08553 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NefmP08553 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NefmP08553 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NefmP08553 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NefmP08553 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NefmP08553 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NefmP08553 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NefmP08553 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NefmP08553 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NefmP08553 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NefmP08553 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NefmP08553 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NefmP08553 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NefmP08553 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NefmP08553 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NefmP08553 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms