Protein–RNA interactions for Protein: P04444

Hbb-bh1, Hemoglobin subunit beta-H1, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh1P04444 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hbb-bh1P04444 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms