Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04212 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04212 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04212 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04212 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04212 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04212 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04212 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04212 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04212 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04212 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04212 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04212 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04212 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04212 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04212 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P04212 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04212 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P04212 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04212 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04212 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04212 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04212 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04212 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04212 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04212 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P04212 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04212 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P04212 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04212 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04212 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04212 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04212 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04212 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04212 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04212 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04212 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04212 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04212 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04212 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04212 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04212 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04212 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04212 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P04212 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04212 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04212 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04212 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P04212 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04212 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04212 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04212 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04212 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04212 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04212 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04212 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04212 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04212 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04212 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04212 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04212 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04212 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04212 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04212 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04212 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P04212 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04212 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04212 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04212 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04212 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04212 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04212 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04212 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04212 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04212 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P04212 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04212 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04212 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04212 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04212 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04212 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04212 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04212 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P04212 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04212 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04212 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04212 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04212 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04212 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04212 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04212 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04212 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04212 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04212 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04212 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04212 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04212 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04212 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04212 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04212 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms