Protein–RNA interactions for Protein: P01915

H-2 class II histocompatibility antigen, E-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01915 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01915 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01915 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01915 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01915 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01915 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01915 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01915 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01915 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01915 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01915 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01915 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01915 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01915 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01915 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01915 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01915 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01915 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01915 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01915 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01915 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01915 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01915 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01915 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01915 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01915 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01915 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01915 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01915 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01915 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01915 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01915 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01915 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01915 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01915 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01915 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01915 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01915 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01915 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01915 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01915 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01915 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01915 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01915 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01915 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01915 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01915 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01915 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01915 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01915 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01915 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01915 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01915 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01915 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01915 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01915 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01915 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01915 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01915 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01915 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01915 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01915 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01915 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01915 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01915 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01915 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01915 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01915 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01915 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01915 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01915 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01915 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01915 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01915 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01915 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01915 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01915 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01915 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01915 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01915 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01915 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01915 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01915 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01915 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01915 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01915 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01915 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01915 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01915 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01915 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01915 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01915 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01915 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01915 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01915 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01915 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01915 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01915 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01915 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01915 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms