Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01667 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01667 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01667 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01667 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01667 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01667 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01667 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01667 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01667 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01667 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01667 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01667 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01667 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01667 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01667 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01667 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01667 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
P01667 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01667 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01667 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01667 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01667 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01667 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01667 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01667 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01667 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01667 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01667 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01667 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
P01667 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01667 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
P01667 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01667 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01667 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01667 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01667 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01667 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01667 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01667 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01667 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01667 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01667 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
P01667 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01667 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01667 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01667 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01667 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01667 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01667 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01667 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01667 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01667 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01667 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01667 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
P01667 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
P01667 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01667 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01667 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01667 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01667 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01667 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01667 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01667 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01667 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01667 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01667 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01667 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01667 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01667 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01667 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01667 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01667 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01667 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
P01667 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01667 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01667 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
P01667 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
P01667 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01667 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
P01667 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01667 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01667 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01667 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01667 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01667 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01667 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01667 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01667 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01667 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01667 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01667 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01667 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01667 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01667 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01667 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01667 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01667 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01667 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01667 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.5 ms