Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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P01649 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01649 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01649 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01649 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01649 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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P01649 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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P01649 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01649 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01649 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01649 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01649 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01649 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01649 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01649 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01649 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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P01649 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01649 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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P01649 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01649 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01649 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01649 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01649 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01649 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01649 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01649 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01649 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01649 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01649 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01649 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01649 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01649 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01649 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01649 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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P01649 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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P01649 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01649 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01649 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01649 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01649 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01649 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01649 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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P01649 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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P01649 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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P01649 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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P01649 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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P01649 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01649 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01649 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01649 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01649 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01649 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01649 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01649 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01649 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01649 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01649 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01649 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01649 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01649 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01649 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01649 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01649 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01649 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01649 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01649 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01649 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01649 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01649 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01649 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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