Protein–RNA interactions for Protein: P01633

Igk-V19-17, Ig kappa chain V19-17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igk-V19-17P01633 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Igk-V19-17P01633 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Igk-V19-17P01633 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Igk-V19-17P01633 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Igk-V19-17P01633 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Igk-V19-17P01633 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Igk-V19-17P01633 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Igk-V19-17P01633 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Igk-V19-17P01633 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Igk-V19-17P01633 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Igk-V19-17P01633 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Igk-V19-17P01633 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Igk-V19-17P01633 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Igk-V19-17P01633 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Igk-V19-17P01633 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Igk-V19-17P01633 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Igk-V19-17P01633 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Igk-V19-17P01633 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Igk-V19-17P01633 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Igk-V19-17P01633 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Igk-V19-17P01633 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Igk-V19-17P01633 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms