Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms