Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hcn2O88703 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms