Protein–RNA interactions for Protein: O88572

Lrp6, Low-density lipoprotein receptor-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp6O88572 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrp6O88572 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrp6O88572 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms