Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AurkcO88445 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AurkcO88445 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AurkcO88445 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AurkcO88445 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AurkcO88445 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkcO88445 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkcO88445 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkcO88445 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkcO88445 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkcO88445 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkcO88445 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkcO88445 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkcO88445 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkcO88445 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkcO88445 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkcO88445 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkcO88445 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkcO88445 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkcO88445 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkcO88445 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkcO88445 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkcO88445 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkcO88445 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkcO88445 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkcO88445 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkcO88445 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkcO88445 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkcO88445 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkcO88445 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkcO88445 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkcO88445 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkcO88445 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkcO88445 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AurkcO88445 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AurkcO88445 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AurkcO88445 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AurkcO88445 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AurkcO88445 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AurkcO88445 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkcO88445 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms