Protein–RNA interactions for Protein: O88430

Ccl22, C-C motif chemokine 22, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl22O88430 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl22O88430 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl22O88430 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl22O88430 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl22O88430 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl22O88430 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl22O88430 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl22O88430 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl22O88430 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl22O88430 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl22O88430 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl22O88430 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl22O88430 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl22O88430 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl22O88430 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl22O88430 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms