Protein–RNA interactions for Protein: O70546

Kdm6a, Lysine-specific demethylase 6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6aO70546 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm6aO70546 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Kdm6aO70546 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm6aO70546 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm6aO70546 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm6aO70546 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms