Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChkbO55229 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChkbO55229 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChkbO55229 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChkbO55229 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChkbO55229 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChkbO55229 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChkbO55229 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChkbO55229 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChkbO55229 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChkbO55229 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChkbO55229 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChkbO55229 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChkbO55229 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChkbO55229 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChkbO55229 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChkbO55229 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChkbO55229 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ChkbO55229 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChkbO55229 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChkbO55229 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChkbO55229 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChkbO55229 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ChkbO55229 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChkbO55229 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChkbO55229 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChkbO55229 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChkbO55229 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ChkbO55229 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms