Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtogO55225 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OtogO55225 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtogO55225 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtogO55225 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtogO55225 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtogO55225 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtogO55225 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtogO55225 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtogO55225 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtogO55225 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtogO55225 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtogO55225 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtogO55225 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtogO55225 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtogO55225 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtogO55225 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OtogO55225 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtogO55225 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OtogO55225 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtogO55225 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtogO55225 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtogO55225 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtogO55225 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtogO55225 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtogO55225 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtogO55225 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtogO55225 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtogO55225 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtogO55225 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtogO55225 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtogO55225 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtogO55225 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtogO55225 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OtogO55225 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OtogO55225 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtogO55225 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtogO55225 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtogO55225 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OtogO55225 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OtogO55225 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtogO55225 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtogO55225 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtogO55225 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtogO55225 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtogO55225 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OtogO55225 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtogO55225 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtogO55225 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtogO55225 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtogO55225 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OtogO55225 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtogO55225 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtogO55225 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtogO55225 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
OtogO55225 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtogO55225 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtogO55225 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtogO55225 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtogO55225 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtogO55225 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
OtogO55225 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
OtogO55225 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtogO55225 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
OtogO55225 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtogO55225 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtogO55225 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtogO55225 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
OtogO55225 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtogO55225 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtogO55225 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtogO55225 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtogO55225 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtogO55225 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtogO55225 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtogO55225 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtogO55225 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OtogO55225 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtogO55225 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtogO55225 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtogO55225 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtogO55225 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtogO55225 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtogO55225 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtogO55225 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtogO55225 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtogO55225 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtogO55225 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtogO55225 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
OtogO55225 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtogO55225 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtogO55225 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtogO55225 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtogO55225 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtogO55225 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OtogO55225 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OtogO55225 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OtogO55225 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OtogO55225 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OtogO55225 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms