Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Supt5hO55201 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms