Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pja1O55176 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pja1O55176 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pja1O55176 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pja1O55176 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pja1O55176 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pja1O55176 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pja1O55176 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pja1O55176 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pja1O55176 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms