Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms