Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms