Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms