Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms