Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptpn20O55082 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms