Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Copb2O55029 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copb2O55029 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copb2O55029 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copb2O55029 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copb2O55029 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Copb2O55029 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copb2O55029 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Copb2O55029 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Copb2O55029 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Copb2O55029 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms