Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SlkO54988 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SlkO54988 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SlkO54988 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SlkO54988 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SlkO54988 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SlkO54988 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SlkO54988 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SlkO54988 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SlkO54988 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SlkO54988 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SlkO54988 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SlkO54988 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SlkO54988 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SlkO54988 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SlkO54988 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SlkO54988 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SlkO54988 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SlkO54988 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SlkO54988 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SlkO54988 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SlkO54988 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SlkO54988 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SlkO54988 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SlkO54988 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SlkO54988 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SlkO54988 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SlkO54988 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SlkO54988 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SlkO54988 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SlkO54988 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SlkO54988 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SlkO54988 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SlkO54988 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SlkO54988 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SlkO54988 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SlkO54988 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SlkO54988 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SlkO54988 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SlkO54988 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SlkO54988 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SlkO54988 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SlkO54988 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SlkO54988 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SlkO54988 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SlkO54988 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SlkO54988 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SlkO54988 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SlkO54988 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SlkO54988 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SlkO54988 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SlkO54988 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SlkO54988 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SlkO54988 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SlkO54988 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SlkO54988 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SlkO54988 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SlkO54988 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SlkO54988 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SlkO54988 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SlkO54988 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SlkO54988 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SlkO54988 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SlkO54988 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SlkO54988 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SlkO54988 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SlkO54988 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SlkO54988 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SlkO54988 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SlkO54988 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SlkO54988 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SlkO54988 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SlkO54988 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SlkO54988 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SlkO54988 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SlkO54988 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SlkO54988 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SlkO54988 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SlkO54988 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SlkO54988 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SlkO54988 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SlkO54988 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SlkO54988 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SlkO54988 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SlkO54988 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SlkO54988 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SlkO54988 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SlkO54988 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SlkO54988 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SlkO54988 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SlkO54988 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SlkO54988 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SlkO54988 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SlkO54988 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SlkO54988 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SlkO54988 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SlkO54988 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SlkO54988 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SlkO54988 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SlkO54988 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms