Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16O54909 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16O54909 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16O54909 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16O54909 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16O54909 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16O54909 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16O54909 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16O54909 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16O54909 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16O54909 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16O54909 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16O54909 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16O54909 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16O54909 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16O54909 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16O54909 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16O54909 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16O54909 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16O54909 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh16O54909 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh16O54909 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh16O54909 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh16O54909 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh16O54909 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh16O54909 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh16O54909 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh16O54909 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh16O54909 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh16O54909 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh16O54909 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh16O54909 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms