Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DffaO54786 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DffaO54786 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DffaO54786 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DffaO54786 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DffaO54786 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DffaO54786 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DffaO54786 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DffaO54786 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DffaO54786 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DffaO54786 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DffaO54786 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DffaO54786 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DffaO54786 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DffaO54786 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DffaO54786 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DffaO54786 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DffaO54786 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DffaO54786 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DffaO54786 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DffaO54786 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DffaO54786 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DffaO54786 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DffaO54786 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DffaO54786 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DffaO54786 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DffaO54786 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DffaO54786 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DffaO54786 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DffaO54786 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DffaO54786 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DffaO54786 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DffaO54786 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DffaO54786 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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DffaO54786 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DffaO54786 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DffaO54786 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DffaO54786 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DffaO54786 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DffaO54786 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DffaO54786 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DffaO54786 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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DffaO54786 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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DffaO54786 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DffaO54786 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DffaO54786 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DffaO54786 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DffaO54786 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DffaO54786 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DffaO54786 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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DffaO54786 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DffaO54786 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DffaO54786 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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DffaO54786 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DffaO54786 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DffaO54786 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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DffaO54786 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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DffaO54786 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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DffaO54786 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DffaO54786 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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DffaO54786 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DffaO54786 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DffaO54786 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DffaO54786 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DffaO54786 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DffaO54786 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DffaO54786 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DffaO54786 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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DffaO54786 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DffaO54786 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DffaO54786 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DffaO54786 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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DffaO54786 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DffaO54786 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DffaO54786 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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