Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cavin1O54724 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms