Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EdaO54693 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EdaO54693 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
EdaO54693 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EdaO54693 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
EdaO54693 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EdaO54693 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EdaO54693 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EdaO54693 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EdaO54693 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EdaO54693 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EdaO54693 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EdaO54693 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EdaO54693 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EdaO54693 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EdaO54693 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EdaO54693 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EdaO54693 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EdaO54693 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EdaO54693 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EdaO54693 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EdaO54693 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EdaO54693 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EdaO54693 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EdaO54693 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EdaO54693 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EdaO54693 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EdaO54693 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EdaO54693 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EdaO54693 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EdaO54693 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EdaO54693 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EdaO54693 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EdaO54693 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EdaO54693 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EdaO54693 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EdaO54693 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EdaO54693 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EdaO54693 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EdaO54693 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EdaO54693 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EdaO54693 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EdaO54693 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EdaO54693 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EdaO54693 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EdaO54693 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EdaO54693 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EdaO54693 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EdaO54693 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EdaO54693 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EdaO54693 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EdaO54693 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EdaO54693 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EdaO54693 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EdaO54693 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EdaO54693 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EdaO54693 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EdaO54693 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EdaO54693 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EdaO54693 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EdaO54693 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EdaO54693 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EdaO54693 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EdaO54693 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EdaO54693 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EdaO54693 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EdaO54693 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EdaO54693 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EdaO54693 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EdaO54693 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EdaO54693 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EdaO54693 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EdaO54693 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EdaO54693 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EdaO54693 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EdaO54693 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EdaO54693 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EdaO54693 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EdaO54693 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EdaO54693 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EdaO54693 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EdaO54693 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EdaO54693 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EdaO54693 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EdaO54693 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EdaO54693 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EdaO54693 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EdaO54693 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EdaO54693 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EdaO54693 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EdaO54693 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EdaO54693 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EdaO54693 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EdaO54693 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EdaO54693 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EdaO54693 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EdaO54693 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EdaO54693 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EdaO54693 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EdaO54693 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms