Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms