Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms