Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl25O35903 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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