Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp100O35892 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp100O35892 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp100O35892 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp100O35892 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms