Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf9O35739 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf9O35739 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf9O35739 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf9O35739 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf9O35739 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf9O35739 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf9O35739 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf9O35739 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms