Protein–RNA interactions for Protein: O35691

Pnn, Pinin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnnO35691 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PnnO35691 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PnnO35691 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PnnO35691 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PnnO35691 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PnnO35691 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PnnO35691 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PnnO35691 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PnnO35691 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PnnO35691 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PnnO35691 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PnnO35691 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PnnO35691 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PnnO35691 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PnnO35691 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PnnO35691 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PnnO35691 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PnnO35691 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PnnO35691 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PnnO35691 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PnnO35691 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PnnO35691 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PnnO35691 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PnnO35691 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PnnO35691 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PnnO35691 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PnnO35691 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PnnO35691 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PnnO35691 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PnnO35691 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PnnO35691 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PnnO35691 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PnnO35691 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PnnO35691 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PnnO35691 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PnnO35691 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PnnO35691 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PnnO35691 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PnnO35691 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PnnO35691 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PnnO35691 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PnnO35691 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PnnO35691 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PnnO35691 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PnnO35691 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PnnO35691 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PnnO35691 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PnnO35691 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PnnO35691 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PnnO35691 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PnnO35691 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PnnO35691 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PnnO35691 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PnnO35691 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PnnO35691 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PnnO35691 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PnnO35691 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PnnO35691 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PnnO35691 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PnnO35691 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PnnO35691 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PnnO35691 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PnnO35691 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PnnO35691 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PnnO35691 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PnnO35691 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PnnO35691 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PnnO35691 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PnnO35691 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PnnO35691 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PnnO35691 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PnnO35691 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PnnO35691 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PnnO35691 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PnnO35691 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PnnO35691 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PnnO35691 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PnnO35691 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PnnO35691 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PnnO35691 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PnnO35691 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PnnO35691 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PnnO35691 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PnnO35691 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PnnO35691 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PnnO35691 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PnnO35691 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PnnO35691 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PnnO35691 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PnnO35691 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PnnO35691 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PnnO35691 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PnnO35691 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PnnO35691 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PnnO35691 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PnnO35691 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PnnO35691 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PnnO35691 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PnnO35691 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PnnO35691 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms